OpenAnno

介绍

OpenAnno是使用GO语言编写的，用于基因测序分析中SNV、CNV变异注释的软件。本软件以ANNOVAR、VEP等注释软件为灵感，在实现主要注释功能的同时，对生产实践遇到部分问题进行优化调整。

声明：本软件以ANNOVAR、VEP注释分析结果为灵感，所有代码均从头编写为参考任何现有代码或算法。

pre: 数据准备
- gb: 基因功能注释相关数据准备
- db: 位点、区域相关数据准备
anno: 变异注释
- gb: 基因功能注释
  - snv: SNV基因功能注释
  - cnv: CNV基因功能注释
- fb: 位点数据库注释，主要针对SNV
- rb: 区域数据库注释
tools: 相关工具
- merge: 合并分析结果，即合并基因功能、位点、区域等多个注释结果到唯一解雇文件
- vcf2av: VCF转本软件专用数据格式（同ANNOVAR avinput）
- av2vcf: 本软件专用数据格式转VCF数据格式

Name		Name	Last commit message	Last commit date
Latest commit History 57 Commits
.vscode		.vscode
anno		anno
cmd		cmd
pkg		pkg
.gitignore		.gitignore
Dockerfile		Dockerfile
README.md		README.md
go.mod		go.mod
go.sum		go.sum
main.go		main.go
prepare.sh		prepare.sh
sort.sh		sort.sh